1、材质不同：
隔离服使用面料有：含导电丝面料、华达呢、纱卡、TYVEK(防酸防碱)等。高密度聚乙烯材料，连体带帽款式设计，透气，透湿，能够阻隔微细粉尘和液体穿透，又能允许水汽透出;轻盈，坚韧，防止静电蓄积，本身不产生尘屑，不含硅。采用专用涤纶长丝，经向或经问纬向嵌织日本钟纺Belltron®9R系列导电纤维，经特殊工艺制造而成。具有优异、持久的导电性能。是人员衣物防静电的必要措施。
防护服除满足高强度高耐磨等穿用要求之外，常因防护目的、防护原理不同而有差异，从棉、毛、丝、铅等天然材料，橡胶、塑料、树脂、合纤等合成材料，到当代新功能材料及复合材料等。具有抗渗透功能，透气性好，强力高，高耐静水压的特点。
2、用途不同：隔离衣在隔离区用也就是医院内用，防护衣是在CDC用。
3、针对患者也有不同：
穿隔离衣：接触经接触传播的感染性疾病患者如传病病患者、多药耐药菌感染患者;对患者实行保护性隔离，如大面积烧伤患者、骨随移植患者的患者;防止受到患者血液、体液、分泌物、排汇物喷溅时被传染。总之隔离衣用于严密隔离、接触隔离和保护性隔离的病人。
穿防护服：接触经空气传播和飞沫传播的传染病患者，可能受到患者血液、体液、分泌物、排汇物喷溅时。但这种病人并不是很严重只是一般性传染。
